針對目前嚴防輸入型疫情防控的常態化形式，琿春南站國際聯運交接所防疫工作再細化，防疫措施再增強。推出一系列防控舉措嚴防疫情，為打贏這場疫情防控戰提供有力支撐。
一、防疫工作再細化：一是外來人員必須登記、體溫測量，佩戴口罩，同時登記手機號、姓名等信息；二是每天定時、定量、定點消毒；三是外出人員必須上報，由風險地區來的外地親屬必須如實上報情況，不得瞞報、漏報。
二、防疫措施再增強：在交接所二樓新增玻璃隔斷作為第二道交接窗口，并在交接所辦公樓東側新設置一處進出通道，于2020年11月7日啟用，實現了穿防護服的車站工作人員與其他人員分別走各自的專用通道。最大程度地降低進出琿春南站交接所人員被動（交叉）感染機會。為打贏這場抗疫戰奠定了基礎保障。
